长春BD单细胞实验平台

单细胞测序结果动辄上百G数据量，庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求，首先针对下机数据的质控环节：单细胞测序产生数亿的结果序列，不可避免的会出现低质量的测序结果，存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征，即碱基测序结果的错误率在1% / 0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后的处理结果的准确性，为后续细胞类型鉴定和功能分析打下坚实基础。BD Rhapsody平台在细胞捕获过程中没有偏好性，可同样无差别捕获中性粒细胞。长春BD单细胞实验平台

据不完全统计，截至2022年6月，烈冰生物助力发表单细胞文章近40篇，从平台应用比例来看，应用10X Genomics和BD Rhapsody两大平台发文比例各占50%左右，研究类型涵盖疾病发展，靶点探索，免疫研究，神经发育，干细胞分化，植物发育，退行病变，糖尿病，COVID-19等等研究；从发表期刊水平来看，烈冰生物联合发表的单细胞文章，CNS一区期刊占比在30%以上，其中包括immunity三篇，Nature子刊3篇（Nature cell biology,Nature Plants，Nature communication）,风湿类领域ARD期刊1篇，CUT 1篇，Advanced Science多篇，IF大于10分以上文章占比高达68.5%，烈冰专属单细胞测序服务团队，将与您携手谱写下一篇“高分”新文章。烈冰生物单细胞实验平台附加流式分选细胞表面Marker，对于较低分辨率的标志物也能有效鉴定，助力高要求测序项目。

单细胞测序技术（Single Cell Sequencing）从一种新兴的研究角度，借助已有的高通量测序手段，帮助研究者在样本中细胞的异质性、免疫微环境、发育学、免疫学以及其他领域中进行单细胞层面的数据解析，解决了Bulk Population Sequencing所无法解决的问题。这样一个新的研究领域必然也需要足够可靠的实验手段来支撑。BD Rhapsody单细胞分选系统为此提供了完善的硬件设备，保证了从单细胞悬液质量评估到单细胞分选标记过程中每一个实验步骤的准确质控。NovelBio单细胞实验团队借助BD Rhapsody单细胞分选系统，在实验实施层面对单细胞测序结果的可靠性提供了强有力的保证。继单细胞悬液制备之后，又在另一道关键关卡提供了可靠的支持，帮助研究者在单细胞测序领域收获更多的成果。

针对单细胞测序的细胞上样数，为什么不建议捕获到的细胞数量越高越好？一味地追求高数量的细胞捕获可能会存在一些问题。例如在上机细胞悬液浓度固定时，如果目标细胞捕获数增加到8000甚至10000，上样细胞悬液体积势必增加，在细胞悬液质量不是很理想（细胞活性<90%、碎片率>5%、结团率均>5%）的情况下，引入的背景信号会增加，分析结果不理想的直接体现包括：cell、non-cell无法有效区分和Fraction reads in cells偏低。当cell和non-cell无法有效区分时，会使得数据出现假阳性和假阴性结果！当目标细胞捕获数很大时，多细胞率会增加，数据分析时，此部分“cell”表现为基因检测数和UMI检测数是正常cell的N倍（N是一个GEM包裹的细胞数），导致所有细胞的统计数据（单个细胞基因检测中位数、单个细胞UMI检测中位数）虚高。此部分“cell”虽然可以通过设置数据分析阈值进行过滤，但是容易会有此类数据的残留和正常高基因检测细胞的人为去除！强势发文！烈冰BD单细胞测序平台助力揭示愈伤组织能再生的机制。

针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中：以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准，每个细胞的reads数大约在50k左右；每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型，例如成熟的B，T，粒细胞数量较多的组织中，由于该类型细胞表达的基因数普遍较少，导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等，他们的基因表达数较高，甚至可以超过1W，这就导致该类样本基因中位数非常高。因此，我们对细胞数量以及基因中位数确认时，需要考察实际组织的细胞组成。单个细胞的基因结构和基因表达状态，并鉴定细胞的类型。湖州BD单细胞实验平台

烈冰单细胞多组学测序助您探究细胞类型特异性和基因调控网络特征。长春BD单细胞实验平台

关于BD Rhapsody单细胞平台的样本类型和样本制备 ：在上机前需要注意细胞消化后的细胞团块，获得分离良好的细胞悬液、且细胞活力高（＞70%）；此外，了解您所研究细胞的大小范围也很重要。细胞大小通常与细胞表达的转录本数量有关。各种尺寸不同的细胞（一般直径不大于50μm）均可与我们基因表达解决方案中使用的BD Rhapsody平台兼容。一般来说，细胞制备方案将根据组织来源和细胞类型而变化。每种组织类型都是独特的，因此，必须在开始任何单细胞实验之前优化样本制备，烈冰多年样本解离消化经验，累积10+物种、50+组织的消化protocol，若您的样本为组织，且尚未成功将组织样本消化成单细胞悬液，烈冰将尽可能提供技术及实验上的帮助。长春BD单细胞实验平台

上海烈冰生物医药科技有限公司拥有生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询，市场营销策划，市场信息咨询与调查（不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验），从事货物及技术的进出口业务，计算机、软件及耗材（除专控），软件开发【依法须经批准的项目，经相关部门批准后方可开展经营活动】等多项业务，主营业务涵盖单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序。目前我公司在职员工以90后为主，是一个有活力有能力有创新精神的团队。公司业务范围主要包括：单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序等。公司奉行顾客至上、质量为本的经营宗旨，深受客户好评。公司力求给客户提供全数良好服务，我们相信诚实正直、开拓进取地为公司发展做正确的事情，将为公司和个人带来共同的利益和进步。经过几年的发展，已成为单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序行业出名企业。