重庆BD单细胞服务机构

时间:2022年07月25日 来源:

关于单细胞测序实验样本制备,这与流式细胞术用户熟悉的步骤完全一致,也就是通过酶促或机械消化、细胞分选或其他细胞分离技术从整个样本中制备生成活的单细胞悬液。随后是细胞计数和质量控制步骤,以确保您的样本有适当浓度的活细胞,并且不含细胞团块和死细胞碎片。如有必要,您还可以使用抗体对样本进行染色,标记细胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通过FACS来富集感兴趣的细胞类型。解离样本时采取的具体步骤将根据您的起始材料和实验目标而定。也许需要额外的制备步骤,具体取决于组织质量、样本丰度、细胞大小,以及是否需要提取出细胞核进行染色质可接近性分析。无论具体的考虑因素如何,所有样本类型都遵循同一个基本原则,那就是生成高质量的单细胞悬液。单细胞测序技术遍地开花,烈冰BD 单细胞测序服务让您的医学研究如虎添翼。重庆BD单细胞服务机构

单细胞测序结果动辄上百G数据量,庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求,首先针对下机数据的质控环节:单细胞测序产生数亿的结果序列,不可避免的会出现低质量的测序结果,存在各种情况的序列污染。因此序列过滤及质量评估就会变得极为重要。序列质量主要通过测序质量值Q20/Q30的占比来表征,即碱基测序结果的错误率在1% / 0.1%以下的比例。理想的测序结果reads的碱基质量均高于30。保证数据获得后的处理结果的准确性,为后续细胞类型鉴定和功能分析打下坚实基础。天津BD单细胞测序服务高通量测序技术是对传统测序一次突破性的改变,一次对几十万到几百万条核酸序列进行测定。

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,针对庞大的单细胞测序数据,能够实现细胞类型鉴定的快、精、准:一键导入gene list构建个性化基因列表;轻松一点即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的颜色和名称助力高效鉴定细胞类型;一键获得t-SNE图、Heatmap和Violin图:轻松获得并下载基因表达的t-SNE图、Heatmap、Violin图,还可以通过调节宽、高和系数比例来调节美观。平台上线300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,帮助烈冰生信分析团队和自主分析用户实现分析工具和模板的快速调用和一站式全流程自动化分析,节省工作时间并提升整体工作效率。

烈冰生物单细胞测序服务体系,不仅提供10X Genomics和BD Rhapsody两大国际认可的单细胞实验平台,在“附加”产品上,我们提供BD FACS Melody流式细胞仪,满足您对特殊细胞类型的富集需求,自主研发的Panocell单细胞捕获芯片,可兼容BD 平台全套原装磁珠、试剂和protocol,为您提供完整的单细胞多组学解决方案。从细胞多样本分析和染色所需的试剂到检测试剂盒,生物信息分析工具,和在线大数据分析系统、精简方案和专业团队技术支持,烈冰生物可为您提供用于单细胞多组学甚至到空间转录组测序的各种工具,助您加速科研探索之旅。单细胞测序因其强大的探究疾病--细胞--基因的关系,一度成为高通量测序技术的“天花板”。

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题,BD平台普遍提供的细胞数量都在1000-10000不等的测序细胞量,特殊研究需求的项目,可提供上限40000个细胞的捕获量(单个样本)。这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此,对于基于基因表达进行准确细胞分型上,无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说,都会更实用。此外针对特殊项目研究,如需要捕获和分析脆弱的细胞,如粒细胞、中性粒细胞、CAR-T细胞、干细胞、移植瘤细胞、骨髓瘤细胞等,烈冰生BD平台也有更好的捕获效能,满足您的实际需求。BD单细胞测序平台同时兼容单细胞蛋白组测序(Ab-seq)和免疫组库测序等工作。深圳BD Rhapsody单细胞多组学测序

单细胞多组学测序可识别重要的转录因子,进行谱系和发育追踪。重庆BD单细胞服务机构

关于BD Rhapsody单细胞平台的样本类型和样本制备 :在上机前需要注意细胞消化后的细胞团块,获得分离良好的细胞悬液、且细胞活力高(>70%);此外,了解您所研究细胞的大小范围也很重要。细胞大小通常与细胞表达的转录本数量有关。各种尺寸不同的细胞(一般直径不大于50μm)均可与我们基因表达解决方案中使用的BD Rhapsody平台兼容。一般来说,细胞制备方案将根据组织来源和细胞类型而变化。每种组织类型都是独特的,因此,必须在开始任何单细胞实验之前优化样本制备,烈冰多年样本解离消化经验,累积10+物种、50+组织的消化protocol,若您的样本为组织,且尚未成功将组织样本消化成单细胞悬液,烈冰将尽可能提供技术及实验上的帮助。重庆BD单细胞服务机构

上海烈冰生物医药科技有限公司位于江月路999号奇亚特中心22幢。公司业务分为单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序等,目前不断进行创新和服务改进,为客户提供良好的产品和服务。公司从事医药健康多年,有着创新的设计、强大的技术,还有一批专业化的队伍,确保为客户提供良好的产品及服务。烈冰生物立足于全国市场,依托强大的研发实力,融合前沿的技术理念,及时响应客户的需求。

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