北京烈冰生物空间转录组测序

时间:2022年08月09日 来源:

10XVisium的实验主要分为两部分:组织学板块和组学板块。组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像,记录切片的形态学信息;组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序,记录切片的转录本信息和空间位置信息。具体实验流程如下:A、切片制备和优化:取新鲜组织、冷冻、切片,并进行HE染色成像,优化确定切片是否覆盖靶向区域。B、切片固定和透化:将组织切片放置在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上,并进行固定和透化,使细胞中的mRNA得到释放,并结合到相应的捕获探针上,从而获取基因表达信息。C、逆转和文库构建:以捕获的RNA为模板,进行cDNA合成,和测序文库制备。D、高通量上机测序:对制备好的测序文库,进行二代高通量短读长测序。E、数据可视化分析:结合HE结果,确定哪些基因有表达,表达量高低,以及这些基因的空间位置信息烈冰生物全转录组测序通过双文库构建,实现多种RNA的一网打尽。北京烈冰生物空间转录组测序

冰冻切片的空间转录组测序在RNA捕获、文库构建方面,需要将组织切片贴合在带有mRNA结合捕获探针的载玻片上,通过甲醛固定、H&E染色得到组织切片的形态结构。再进行透化处理,使细胞中的mRNA释放,并结合到芯片相邻的捕获探针上。将捕获的mRNA反转录合成cDNA并构建测序文库进行上机测序,从而获取基因表达信息。总体来说,空间转录组的实验流程包括:组织冻存-OCT包埋-冷冻切片-固定染色-组织透化-cDNA合成及建库-上机测序,而需要客户进行样本准备的步骤相对简单:组织冻存与OCT包埋。上海烈冰科技空间转录组商业化服务空间转录组测序技术遍地开花,烈冰服务让您的生物医学研究如虎添翼。

多样本数据合并:FractionofReadsKept:合并样本时,各样本根据MappedBarcodedReadsperCell数量计算出来的数据利用率。如果各样本间该参数值相差很大,需要进行Downsample处理,以数据量少的样本为基准将不同样本中细胞测序深度标化到同一水平,从而避免因测序深度差异导致的基因检测数量、基因表达水平的差异。烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深入解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!

烈冰生物已空间转录组测序服务提供从一个组织切片样本中获取包括空间信息在内的全部转录组数据,从而可以区分和定位功能基因在特定组织区域内的活跃表达。其可以检测组织样本中的所有基因活动,并绘制活动发生的位置,这将有助于科学家更好地构建生物图谱,并进一步理解疾病和生物学过程。目前,空间转录组主要应用于多种疾病、免疫、发育、神经和病理学等研究领域。烈冰生物具有专业的实验团队、丰富的切片经验,配置了国际主流的仪器设备,实验团队针对不同组织类型优化完善实验方案,并制定了严谨规范的实验室SOP流程,保证空间转录组切片的质量,全优保障测序数据质量。空间转录组测序技术的迅速发展和应用推广,为从多维度揭示疾病进展提供了强有力的工具。

空间转录组测序是在组织原位检测全转录组基因表达的⼀种技术,可以展⽰组织切⽚中不同区域的基因表达情况,同时能够得到⽬的基因在组织内部的空间位置信息。与传统的全基因转录组或单细胞转录组测序相⽐,空间转录组测序浆病理影像(H&E染⾊)与测序数据映射在⼀起,进⽽可以分析组织切内部空间结构的细胞异质性。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境,将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学等领域的研究利器。搭建多种测序数据的生物信息分析平台,5000+项目检验,真实可信赖。无锡高通量测序空间转录组测序服务

烈冰一站式多平台测序服务:立足科学研究,解码生命本质。北京烈冰生物空间转录组测序

我国高度重视单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序的供应保证工作,推动研发和供应保证也是深化医药卫生体制改进的重要任务。医药相关部门多次发布政策文件,鼓励单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序的研发和生产,提高医药的供应保证能力。从目前生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】的公开数据看,原材料成本、研发成本、生产成本等占医药整体成本相对较低,占据高比例的是运营成本、商务成本、资本成本等。预计随着“4+7”试点扩大、后续品种的增加,制药工业的营销费用将会面临巨大的下跌。随着2020年离我们已经越来越近,遵循政策导向,调整企业布局将成为未来企业战略布局的重中之重。随着我国医药健康深入推进、“两票制”进一步推行,以及各项行业政策的出台,使得我国冷链物流市场规模不断扩大。对于冷链物流行业而言,“十三五”规划时期是冷链物流调整和发展的关键时期。随着科学技术发展,医药冷链物流技术不断涌现,同时在我国高度重视下,冷链物流标准逐渐完善。但我国医药健康仍存在体系不完善、物流成本高和技术、设施落后的问题。在市场机遇与现存问题面前,如何把握医药健康未来发展趋势显得尤为重要。北京烈冰生物空间转录组测序

上海烈冰生物医药科技有限公司属于医药健康的高新企业,技术力量雄厚。公司是一家有限责任公司(自然)企业,以诚信务实的创业精神、专业的管理团队、踏实的职工队伍,努力为广大用户提供高品质的产品。以满足顾客要求为己任;以顾客永远满意为标准;以保持行业优先为目标,提供高品质的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。烈冰生物自成立以来,一直坚持走正规化、专业化路线,得到了广大客户及社会各界的普遍认可与大力支持。

信息来源于互联网 本站不为信息真实性负责