宁波BD空间转录组测序服务

时间:2022年08月09日 来源:

烈冰配置了LEICA CM1950冷冻切片机,搭配切片经验丰富的实验团队,可以提供一致性更高、实验操作更精细的冷冻切片准备方案,保持密切高效的沟通,设计更适合的实验方案,确保每一个实验细节有效进行;烈冰升级配置尼康相差显微镜和CCD成像系统,更高清分辨率解析组织切片原始图像信息,10X,20X,40X,60X更多物镜选择,为不同大小的样本提供更清晰的图像,更精细的图像信息采集、拼接策略,为样本内微小区域的组织学提供更清晰的影像;烈冰空间转录组测序助您深入探究细胞类型特异性和基因调控网络特征。宁波BD空间转录组测序服务

10XGenomics和Drop-Seq的技术原理。是利用十字交叉的通道,从横向孔道中逐一输入凝胶微珠,纵向孔道输入细胞,凝胶微珠与细胞碰撞后会吸附在凝胶微珠上,并通过微流控技术,将之输入到油相孔道中。这时候,就形成了一个个油滴后输出并收集在EP管中。每一个油滴中会落入一个细胞以及一个凝胶微珠,那么在每一个凝胶微珠中上长满了不同的CellBarcode和UMIBarcode连接形成的序列,再加上一端PolyT的抓手,构成我们的捕获凝胶微珠。而这个凝胶微珠抓手就会使用oligodT抓住mRNA构建文库,进而完成细胞中RNA的捕获过程。上海BD Rhapsody空间转录组技术支持烈冰全线实验平台满足超深度、大规模发现和复杂疾病研究的测序。

空间转录组测序的关键就在于,解决了空间位置保留的问题。被放置在芯片区域内的冰冻组织切片在经过H&E染色和成像记录后,会被进行透化处理,释放细胞中的RNA。芯片上的捕获引物的中段设置了带有独特标识的条形码区域。芯片被划分为了数个不同的捕获区域,每个捕获区域中锚定的引物都带有不同的条形码序列。每个区域对应的组织位置会被记录下来,然后再进行测序后,通过条形码将不同区域的测序结果,映射到对应的组织位置上,拼贴形成组织样品的空间转录组图像。

空间转录组测序是在组织原位检测全转录组基因表达的⼀种技术,可以展⽰组织切⽚中不同区域的基因表达情况,同时能够得到⽬的基因在组织内部的空间位置信息。与传统的全基因转录组或单细胞转录组测序相⽐,空间转录组测序浆病理影像(H&E染⾊)与测序数据映射在⼀起,进⽽可以分析组织切内部空间结构的细胞异质性。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境,将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学等领域的研究利器。烈冰生物为您提供一站式全流程高通量测序服务。

细胞中基因的表达是严格按照时间和空间顺序发生,因此细胞类型和基因表达具有时间特异性和空间特异性。时间特异性可以通过收集不同时间点的样本进行单细胞转录组测序来分析。但是单细胞测序结果动辄上百G数据量,庞大的数据对于分析平台和分析能力有着很高的要求,单细胞转录组测序(scRNA-Seq)在单细胞悬液制备的过程中破坏了细胞的空间结构,无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息。而空间转录组可以解决这个问题,其以点阵形式记录组织切片细胞的空间信息。经验丰富的实验团队,为获得示组织内真实表达水平的高质量冷冻切片提供硬件和技术保障。厦门上海烈冰生物空间转录组测序服务公司

从样本处理到终端数据分析,只要您需要,烈冰提供全流程的无忧服务。宁波BD空间转录组测序服务

空间转录组研究的的必耍性:研究单细胞是想要探究细胞间的异质性,但是常规的单细胞是将细胞解离成单细胞悬液,然后利用单细胞分离技术(微孔,微板,液滴)等方法实现单细胞建库,这里比较大的问题是是细胞失去了原本在组织的空间信息。然而这个空间信息在实际研究中是非常重要。特别是在研究细胞命运机制及细胞谱系发生空间位置的信息显得尤为重要,因此发展空问转录组技术实现细胞的位置信息的保留,对研究此类细胞状态尤为必要。宁波BD空间转录组测序服务

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