南京单细胞多组学服务机构

时间:2022年08月12日 来源:

当下,单细胞测序已经广泛应用于多种疾病发展过程中的关键过程和事件,如疾病从轻症病变向恶性的转化、恶性向转移病变的发展,以及疾病对多种药物的反应等等。单细胞测序技术作为一个需要将组织解离成为单细胞悬液,或者是采用细胞核捕获的策略捕获单细胞核,进而对于每一个单细胞或者细胞核进行测序得到结果的技术,其空间定位信息是丢失的。这就衍生出了一个问题就是如果单细胞A与B并不出现在一个组织区域中他们会互相影响或者转化么?免疫研究中,两个具有非常强的PDL1-PD1的配对关系的细胞在组织切片上风马牛不相及,这样PDL1-PD1的关系会生效么?单细胞多组学的研究对生物标志物的发现,细胞分化发育研究等均有重要意义。南京单细胞多组学服务机构

单细胞测序实验再样本细胞上机分选签,需要对细胞数量、细胞活性进行准确判断,这对SingleCell分选标记、建库、下机数据的质量都具有着决定性的作用。如若细胞计数偏高,将会影响建库的成功率;计数偏低,则会显著提高双细胞的比例;而细胞活率过低,就会使测序数据的利用率大打折扣,因此把好单细胞悬液质量这一关尤为重要。而在铺板过程中,由于不同操作人员手法具有不可避免的差异,不同的液体流速将直接影响单细胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody单细胞分选平台配套了专门定制的电动移液器,其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多种操作模式,来对应各种不同的操作。通过已经设定的程序来控制液体的流速,大幅度降低人为操作习惯带来的差异,保证实验操作的一致性。青岛上海烈冰生物单细胞多组学测序价格单细胞多组学测序技术是在单细胞分辨率下精确分析细胞异质性和基因调控网络的新技术。

其实,空间转录组的概念早就已经存在了,目前已经发表的空间转录组技术有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。但是这些方法存在操作复杂、检测精度不准确、基因和细胞检测量的限制等问题。10xGenomics公司升级spatialTranscriptomic后推出的Visium空间基因表达解决方案是一款商业化的高精度、高通量空间转录组测序方案。烈冰科技自2020年起,国内率先搭建空间转录组测序服务平台,联合上线单细胞核转录组测序、AbSeq、单细胞TCR-Seq、单细胞ATAC-Seq(ARCHR测序)、空间转录组测序产品结合scRNA-Seq服务,多组学联合助力科研人员探索时空等多维度、多角度的动态变化的生物学信息。烈冰生物为您提供贴心的单细胞研究完整解决方案!

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题,10X平台普遍提供的细胞数量都在1000-20000不等的测序细胞量,这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此,这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上,无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说,都会更实用。同时依托Random Cell Label技术,使得其对于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等设备存在的Index hooping现象,相对于Smart-Seq数据来说,影响几乎可以忽略不计(10X Genomics官方网站曾给出hooping测试结果,显示无影响。多组学技术结合了不同的生物数据集,如基因组学、转录组学和蛋白质组学。

BD的技术不再采用利用微流控孔道射出细胞和射出的磁珠碰撞的过程,进行单细胞捕获的技术,转而采用CytoSeq特有的蜂窝板技术。该技术用20万+的微孔(该数量级远大于Input细胞数量),保证单孔中的单细胞捕获。同时避免了10X中存在的概率碰撞影响捕获效率的问题,采用微孔捕获相对会有更好的捕获效率(来自两家企业商业宣传资料比对),保证Input细胞的高效使用。对于Input细胞的量更少的情况,可以基于百万级别的细胞总量开始进行前期处理以及后期捕获操作。而在细胞捕获完成后,进行细胞裂解后,同样的也进行细胞中RNApolyA序列的抓取工作。在单细胞转录组领域,将转录组与蛋白质结合的代表性例子只有单细 胞RNA测序方法。重庆上海烈冰生物单细胞多组学商业化服务

单细胞多组学可从整体层面快速有效地探寻疾病发生、发展的根本原因或药物作用靶点等信息。南京单细胞多组学服务机构

当蜂巢孔内同时落入细胞和磁珠后,接下去可以往BDCartridge板中加入细胞裂解液对细胞进行裂解,使细胞内的RNA与磁珠上的标签进行结合,完成每个细胞内RNA的捕获和标记。这时,再将捕获了RNA的磁珠进行回收,待所有质控结果确认通过后就可以进行后续的RNA反转录、cDNA第二链合成等实验操作。而BDCartridge板则需要再进行一次成像,获得磁珠收集后的扫描图,判断磁珠是否已经被有效收集。根据每一步的质控结果,烈冰科技(NovelBio)单细胞测序实验团队会根据单细胞分选的实验结果生成实验总结报告,判断每一步骤是否通过质控,并得到捕获的单细胞数量以及双细胞比例,对整个实验进行总结评估。若所有过程通过质控,实验样本即可进行下一步实验操作。南京单细胞多组学服务机构

上海烈冰生物医药科技有限公司位于江月路999号奇亚特中心22幢。公司业务涵盖单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序等,价格合理,品质有保证。公司注重以质量为中心,以服务为理念,秉持诚信为本的理念,打造医药健康良好品牌。烈冰生物秉承“客户为尊、服务为荣、创意为先、技术为实”的经营理念,全力打造公司的重点竞争力。

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