深圳BD单细胞多组学技术支持

时间:2022年08月12日 来源:

空间转录组测序的数据分析基本分为三个阶段:1.数据的预处理部分;2.Spot点阵的分群与定义;3.Spot分群的功能与生物学价值。每一个部分都不可或缺,其结果都对后续的分析结果有重要影响。由于空间转录组的序列结构与单细胞转录组测序的左端序列结构是非常接近的,都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕获区域这样的设计。右端普遍为捕获的RNA序列。因此采用单细胞的原始数据过滤策略即可,左端可以考虑切下捕获区域前的序列区域作为后续分析用的序列以减少分析负荷。随后,采用10X官方的Spatialranger的策略进行后续分析,解析出位于空间位置中的有效的Spot表达矩阵。单细胞转录组技术在多个研究领域都发挥了重要的推进作用,揭示了组织中微量的细胞类型和基因表达特征。深圳BD单细胞多组学技术支持

单细胞多组学技术优势:1. 构建蛋白质数据库,大幅度提高蛋白质鉴定数量;2. 不同层面表达水平分析,构建表达“全景图”;3. 多组学交叉验证:深层次挖掘其中调控机制;4. 对基因突变信息在蛋白水平上进行验证;5.精细医疗:实现genomics到protegenomics的转变。生物领域各个研究方面,1. 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;2. 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;3. 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型等;4. 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;5. 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;6. 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;7. 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;8.食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。合肥single cell RNA单细胞多组学测序服务烈冰专精单细胞多组学测序领域。

BDRhapsody单细胞分选系统集成了荧光显微成像系统,可以对不同荧光标记的细胞进行检测并计数。在进行质量评估之前,首先要将细胞的培养体系更换成上机所需的Buffer。在这个过程中,需要进行多次离心、重悬操作,烈冰Novelbio单细胞实验团队推荐采用水平转子离心机来进行这步操作。这种离心机可以有效减少细胞在多次更换Buffer过程中的损失,尤其是对于细胞量较少的样本来说,显得非常有必要。更换完Buffer之后,还需要将细胞进行过筛操作,去除较大的细胞团,获得较为纯净的单细胞悬液。

烈冰科技自主研发的单细胞云平台致力于帮助每一位客户定制化分析数据,深入解读数据分析结果,深入挖掘其背后的生物学意义;从操作便捷、结果可视化、分析可追溯、系统稳定等方面助力单细胞研究,加速科研进程!此外,烈冰生信团队根据丰富的实战经验为用户量身打造了一款单细胞测序结果解读的神兵利器——单细胞浏览器(SingleCellBrowser),不仅可以将海量复杂的结果文件可视化,还可以实现分析结果的三维立体化的展示呈现。专业的生信代码交给专业的烈冰,专业的生物学意义交给专业的您!单一的转录本研究不能体现生命进程的变化,因此多组学联合分析成为解析生命进程的有力工具。

BD的技术不再采用利用微流控孔道射出细胞和射出的磁珠碰撞的过程,进行单细胞捕获的技术,转而采用CytoSeq特有的蜂窝板技术。该技术用20万+的微孔(该数量级远大于Input细胞数量),保证单孔中的单细胞捕获。同时避免了10X中存在的概率碰撞影响捕获效率的问题,采用微孔捕获相对会有更好的捕获效率(来自两家企业商业宣传资料比对),保证Input细胞的高效使用。对于Input细胞的量更少的情况,可以基于百万级别的细胞总量开始进行前期处理以及后期捕获操作。而在细胞捕获完成后,进行细胞裂解后,同样的也进行细胞中RNApolyA序列的抓取工作。单细胞多组学测序技术是在单细胞分辨率下精确分析细胞异质性和基因调控网络的新技术。温州single cell 单细胞多组学多组学测序

单细胞多组学突破了以往单细胞检测的单一性,可更多样化。深圳BD单细胞多组学技术支持

SingleCellSequencing技术,即利用优化后的高通量测序技术(NGS,NextGenerationSequencing)分析每一个单个细胞的序列信息,从而更高分辨率地揭示细胞间的细胞差异以及其在微环境中的功能情况。那么问题来了,如何获得单个细胞?如果无法获得单个细胞这一切都是不成立的;如何获得大批量的单个细胞?单个组织细胞群体通常在百万级别以上,如果被检测的测序细胞数量过小精确度不足;如何低成本地获得大批量单个细胞?单细胞测序成本非常高,尤其是需要测2000~3000个以上的细胞的时候,如果单个细胞的分选成本也很高,技术根本无法普及。所以,正因为这些问题的存在使得高通量测序在单个细胞测序应用中的普及度一直不足,直到几个突破性技术的诞生。深圳BD单细胞多组学技术支持

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