杭州ATAC测序服务机构

基于10X Next GEM技术，单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近万个细胞，可在一个样本中同时获5'端mRNA表达谱、TCR和BCR的信息，结合基因的表达谱和V(D)J数据进行复杂组织样本的是影响免疫应答分析，监测免疫疗法的效果，研究疾病发生、发展的分子机制。 烈冰单细胞免疫组库平台具备：1000+ TCR/BCR项目经验，一次实验可同时获取1000-20000个细胞的文库构建，获得转录组和免疫组数据； 具备完善的免疫组库测序和实验质控流程，获取V(D)J全长序列的配对信息；丰富的免疫组库测序和数据分析经验，实现专属个性化数据分析服务，搭配单细胞分析云平台，一键导出交互性的动态结果报告。十二年测序经验，烈冰生物单细胞多组学领域的佼佼者。杭州ATAC测序服务机构

什么是染色质可及性？ 正常情况下，DNA与核小体缠绕折叠在一起形成染色质，但是DNA的复制、转录都是需要将染色体的高级结构解开的，然而解压并不需要将整个染色体全部打开，而只需要打开一部分，即需要表达基因的区域。这部分打开的染色质，就叫开放染色质（open chromatin）。打开染色质，允许部分调控蛋白（比如转录因子和辅因子）过来与之相结合的特性，即染色质的可及性（chromatin accessibility）。ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing），即利用转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术，通俗来说就是将携带测序信息的转座酶等插入开放性染色质中进行识别，进一步通过高通量测序及生物信息学分析来挖掘相关基因信息，以探究生物学相关问题。与ScRNA-Seq类似，ScATAC-seq也是在ATAC-Seq的基础上，解决不同细胞群体的异质性的问题，检出混杂样品测序所无法得到的异质性信息。宁波BD VDJ测序平台全线搭建BD Rhapsody单细胞测序平台。

reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中：以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准，每个细胞的reads数大约在50k左右；每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型，例如成熟的B，T，粒细胞数量较多的组织中，由于该类型细胞表达的基因数普遍较少，导致基因中位数下降。而某一疾病组织、或者体外培养的如干细胞等，他们的基因表达数较高，甚至可以超过1万，这就导致该类样本基因中位数非常高。因此，我们对细胞数量以及基因中位数确认时，需要考察实际组织的细胞组成。

空间转录组测序的数据质量和玻片有效区域的利用率、贴片的质量和透化时间息息相关。贴片质量不良会影响总的有效spot数等；而透化不合理会导致spot的reads数、基因中位数等参数。而 在特异性基因表达方面，我们也可以统计空间转录组群体的特异性基因表达即Markergene，将他们在组织切片以及空转上进行着色。我们也可以对于任意一个已知的基因或者数据库中的一些细胞Marker，然后将其在基因表达在空间转录组的切片以及HE染色上展示自己的基因表达进而了解，群体中的可能的细胞组成关系。 烈冰科技已建立了基于单细胞测序的高通量测序实验多平台。

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台，可实现零代码操作、简单方便：单细胞浏览器的操作简单，不需要命令行操作。简单拖拽、设置参数即可运行，即使生信0基础用户也可以运用自如；可视化展示海量结果文件：可视化展示Cluster的基因数，UMI数量、线粒体RNA占比信息；以及不同Cluster对应的细胞数量、基因表达量、RNA表达量、样本细胞分布、线粒体RNA表达量等；3D立体展示，文章动图先人一步：单细胞浏览器针对t-SNE图、UMAP图和pseudotime结果进行三维立体展示，更加直观立体的观察细胞分布和聚类情况。烈冰生物首批引进 Chromium X 平台，开启百万级通量单细胞测序新时代。南京RNA测序技术支持

烈冰开展了单细胞转录组、单细胞多组学以及空间转录组等多种产品在内的全套科研解决方案。杭州ATAC测序服务机构

空间组测序技术，作为现阶段单细胞技术的重要补充技术进入了组学的实验领域以及生物信息学的分析领域。通过单细胞测序（单细胞表达尺度）+ 空间转录组测序（空间表达尺度）+数字病理（临床诊断尺度）联合分析可在空间和时间上描述不断演变的组织生态系统，多角度深入分析组织的形态特征、基因组学特征、表观遗传调控因子以及样本中的免疫微环境。不同于单细胞测序分析的需求-分析-需求-分析的模式，空间转录组分析实际上是非常需要研究者和企业之间的互动的，尤其是对于组织切片的理解，一个在线互相交流空间转录组测序结果的系统也是空转分析中不可或缺的一环，也是重中之重。杭州ATAC测序服务机构

上海烈冰生物医药科技有限公司致力于医药健康，以科技创新实现高品质管理的追求。烈冰生物深耕行业多年，始终以客户的需求为向导，为客户提供高品质的单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序。烈冰生物致力于把技术上的创新展现成对用户产品上的贴心，为用户带来良好体验。烈冰生物创始人陈岱，始终关注客户，创新科技，竭诚为客户提供良好的服务。