福州烈冰科技单细胞测序

时间:2022年08月16日 来源:

二代测序技术在测序方法上取得了重大突破,基于“边合成边测序”(sequencingbysynthesis)和大规模平行测序技术(massiveparallelanalysis,MPS),使测序通量和读取速度得到极大提升,例如IlluminaSolexa测序仪。Illumina的测序原理可以简化为四步:样品文库构建、簇生成、测序和数据分析。由于读长限制,样品DNA或由RNA逆转录得到的cDNA需要被打断成300-500bp的片段,并在3和5端接上3种序列:1)Index,用于区分样品来源;2)Adapter,用于结合测序通道上的位点;3)Primerbindingsite,用于结合PCR引物启动扩增反应。


烈冰引进国际主流单细胞和空间转录组测序平台,保障细胞精度的前提下提供组织内部精细区域的空间信息。福州烈冰科技单细胞测序

截至2022年6月,烈冰生物助力发表单细胞文章近40篇,从平台应用比例来看,应用10X Genomics和BD Rhapsody两大平台发文比例各占50%左右,研究类型涵盖疾病发展,靶点探索,免疫研究,神经发育,干细胞分化,植物发育,退行病变,糖尿病,COVID-19等等研究;从发表期刊水平来看,烈冰生物联合发表的单细胞文章,CNS一区期刊占比在30%以上,其中包括immunity三篇,Nature子刊3篇(Nature cell biology,Nature Plants,Nature communication),风湿类领域ARD期刊1篇,CUT 1篇,Advanced Science多篇,IF大于10分以上文章占比高达68.5%,烈冰专属单细胞测序服务团队,将与您携手谱写下一篇“高分”新文章。陕西10X Chromium X单细胞测序数据分析可视化烈冰实验室包含从样本处理到测序下机的全套实验平台。

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,针对庞大的单细胞测序数据,能够实现细胞类型鉴定的快、精、准:一键导入genelist构建个性化基因列表;轻松一点即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的颜色和名称助力高效鉴定细胞类型;一键获得t-SNE图、Heatmap和Violin图:轻松获得并下载基因表达的t-SNE图、Heatmap、Violin图,还可以通过调节宽、高和系数比例来调节美观。平台上线300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,帮助烈冰生信分析团队和自主分析用户实现分析工具和模板的快速调用和一站式全流程自动化分析,节省工作时间并提升整体工作效率

对于单细胞测序而言,常常需要先构建细胞图谱,在此基础上再开展后续各项分析,并且数据分析时以细胞聚类(cellcluster)为讨论对象,而不是像常规Bulk测序一样以组别为分析对象,因此单细胞测序项目对样本入组要求没有Bulk测序那样严格,但是单细胞测序,特别是目的为图谱研究时,需要通过提高样本复杂度(增加样本数),尽可能的构建某一疾病类型、群体细胞图谱信息。因此,单细胞测序实验设计时首先需要保证生物学重复,不同样本来源的样本建议单独进行细胞解离和捕获、建库、测序,以保证捕获到足够的细胞数,单个样本分别捕获细胞时,后续分析除了整体分析以外,还可以做单样本分析,保证分析的完备准确性。高通量测序技术是对传统测序一次颠覆性的改变,一次对几十万到几百万条核酸序列进行测定。

10XGenomics是一种基于drop的微流控技术,液体在配套芯片中的微管道中流动,因此细胞直径会受到芯片中微管道直径的限制,微流体通道的直径约为50~60um,因此捕获细胞的直径不能超过40um。当细胞直径过大时,容易出现管道堵塞,造成GEM生成失败,对于神经科学研究和心血管疾病研究的老师而言,准备采用单细胞技术用于课题研究的时候,往往会遇到一个尴尬的问题,就是目标细胞,例如神经元细胞、成熟心肌细胞由于体积过大,不适用于10X单细胞技术。其中神经元细胞的直径很大,直接超过了芯片中管道的直径,虽然心肌细胞直径低于50um,但是成熟心肌细胞的长度很长,有可能堵塞通道造成实验失败,这也是为什么现在很多已发表的心脏单细胞文章,主要研究方向是心脏发育的原因了,主要还是因为未发育成熟的心肌细胞比较小,不会出现堵塞管道的风险。因此可以考虑组织解离后过40um滤网,过滤掉大细胞,避免出现管道堵塞、实验失败的风险。此种方案的缺点是大细胞被过滤掉,丢失相关细胞数据;另外组织解离获得高质量细胞悬液以后,继续做细胞裂解抽细胞核,开展细胞核测序。具体可访问烈冰官网给我们留言,烈小冰将安排专业技术为您详细解答。烈冰全线实验平台满足超深度、大规模发现和复杂疾病研究的测序。苏州10X Genomics单细胞测序多组学测序

单细胞测序平台,烈冰提供高性价比服务方案。福州烈冰科技单细胞测序

在政策促进下,未来3—5年内,我国将在医药健康短缺地区建设一批高水平临床医治中心、高层次的人才 培养基地和高水平的科研创新与转化平台,培育一批品牌优势明显、跨区域提供高水平服务的集团。在《2019年本》鼓励类条目中增加了“单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序的开发和生产”。在中药产业领域,增加了“中药饮片炮制技术传承与创新,中药经典名方的开发与生产,中药创新的研发与生产”等内容。根据单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序相关领域极新技术发展趋势,《2019年本》在鼓励类条目中新增了新型技术开发和应用的有关内容。例如,在化学原料药领域增加了“连续反应”等技术,在技术领域增加了“基因医治”和“抗体偶联”等技术,在药用包装材料领域增加了“中性硼硅药用玻璃”等新型材料与技术的开发应用,在医药领域增加了“人工智能辅助医药设备”等新技术内容。新增内容体现了我国医药产业技术升级的方向,有助于引导企业紧跟国际前沿技术,加快开发具有国际竞争力的新产品,提高产业化水平。既是单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序当前发展的重要方向,也是我国重视中医药传承与创新发展的重要体现。福州烈冰科技单细胞测序

上海烈冰生物医药科技有限公司坐落在江月路999号奇亚特中心22幢,是一家专业的生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】公司。公司目前拥有较多的高技术人才,以不断增强企业重点竞争力,加快企业技术创新,实现稳健生产经营。公司以诚信为本,业务领域涵盖单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序,我们本着对客户负责,对员工负责,更是对公司发展负责的态度,争取做到让每位客户满意。公司力求给客户提供全数良好服务,我们相信诚实正直、开拓进取地为公司发展做正确的事情,将为公司和个人带来共同的利益和进步。经过几年的发展,已成为单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序行业出名企业。

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