lncRNA高通量测序公司

时间:2022年09月02日 来源:

生工高通量测序样品要求,环境样品:如果是新鲜土壤/污泥样品,可以以冰袋运输,不超过3天;如果是冻存过的样品(-20°C或者-80°C冰箱保存),为避免反复冻融,建议用足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,3公斤块状干冰可以维持30-40小时)寄送;如果是水体样品,建议采用滤膜过滤后,将滤膜寄送来生工。生工不负责过滤。要求滤膜3张,冰袋运输,不超过3天。其余特殊环境样品,具体咨询生工高通量测序部。

DNA样品:请提供电泳胶图,浓度>20 ng/μl,总量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA,可冰袋运输,不超过3天。 Illumina HiSeq2500/4000 可以运行PE150/PE250模式。lncRNA高通量测序公司

生工高通量测序样品要求,组织/细胞样品:请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C冰箱,用足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,3公斤块状干冰可以维持30-40小时)寄送;于微生物样品,请客户如实声明所属物种,对于可能致病的微生物,生工保留拒收的权利;对于需要进行RNA抽提的样品,可以但不建议将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送,具体情况请先取得沟通。上海地区基因组高通量测序服务近年来,随着高通量测序技术的发展和普及,单细胞测序技术发展十分迅速。

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序,其研究主要包括3个方面:第一种为不参考任何现有序列从头组装测序,是对未知基因组序列的物种进行基因组测序,并综合利用不同测序技术和生物信息学工具对研究物种进行序列拼接和修正,进而获得该物种的基因组序列图谱;第二种为常见的全基因组重测序,是对已知基因组序列的物种进行个体或群体的测序研究,建立一个测序文库进行单个个体或不同个体混合池测序,发现遗传变异标记,进行后续的研究;第三种是在已有参考基因组序列图谱的基础上,对不同品种的具有代表性个体建立多个文库进行全基因组从头组装测序,此方法能够进一步的进行参考基因组的修补和发现短序列比对难以发现的遗传变异。生工生物拥有众多生物信息分析人才,可进行专业的项目分析,为客户提供个性化服务。

KBSeq全质粒测序跟一代测序相比有什么优点呢?一代测序:1.数据质量,套峰,双峰等情况,需要人工分析校对。2.测序长度,1 kb。3.成本,低。4.样本用量,100 ng。5.精确度,70-90%。6.测序能力,需要测序引物,只能测测序引物间的片段序列。7.通量低,(与读长有关)。8.实验周期,如果片段长度超过5K,测通可能需要15天左右。对于测序长度较长,如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间,而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天,就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。KBSeq全质粒测序对于样本的量,要求的也比较少,比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl,如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的,KBSeq就更为适合了。生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容(以生工分析报告模板为准),全部无费用。

真核/原核有参mRNA-Seq,项目介绍:转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的gather,狭义上指所有mRNA的gather。转录组是研究基因表达的主要手段,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带。转录水平的调控是生物体重要的调控方式,通过转录组测序分析转录水平的调控,是目前运用较多的研究方式。测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据经过质控后,mapping至参考基因组序列,对mapping到基因上的reads进行计数,计算基因的表达量后,进行基因表达差异及差异基因GO、KOG(原核生物为COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。对于多个样本,可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外,依据参考基因组,可进行诸如基因覆盖度、测序饱和度等验证性分析;可变剪切分析、SNP/InDel分析、新转录本预测以及联合miRNA数据进行关联分析等分析。另外,还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析,深入研究基因功能,进一步揭示基因间互作网络等信息,为研究网络调控机理提供方向。请合理安排样品寄送时间,避免样本在周六、周日或法定节假日到达生工生物。上海多重扩增高通量测序平台

生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!lncRNA高通量测序公司

2021年11月1日,在这个平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量测序部迎来了一位新成员——10xGenomics Chromium X!不要看我们个头小,我们可是百万级单细胞捕获神器吆。X是如何实现单次运行有这么高的吞吐量呢?多通道+高捕获+10x的CellPlex多样本混样技术。X仪器本身有16个通道(Controller为8通道),每个通道比较多捕获20000个细胞(Controller为10000个细胞)。再结合10x的CellPlex多样本混样技术,每个通道比较多可捕获60,000个细胞,去除双细胞率后,每张芯片比较多可捕获750,000个单细胞。lncRNA高通量测序公司

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