河北区m1A分析

时间:2023年08月11日 来源:

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供,是在已发表实验方法的基础上开发而来,方法简述如下:片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用proteinA磁珠(ThermoFisher)在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂(ThermoFisher)进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒(NEB)建库,并在IlluminaHiseq测序仪上进行双端150bp测序。伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其存在于各种细胞系中。河北区m1A分析

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样本要求:样品类型:组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:细胞:>1×108,组织:>5g ,总RNA:>300μg(OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5;无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾28S:18S≥1.5或者RIN≥7),样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成5-10mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。平谷区m1ARNA甲基化测序上海云序生物,一家专业做测序,试剂盒的良心企业。

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RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6ARNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰,在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的专业者,可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务(m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。

云序生物提供比色法检测整体m6A修饰水平、RNA修饰测序、MeRIP-qPCR验证、RIP和RNApull-down机制等研究服务。2016年至今,检测样本数量累积超过5000+,MeRIP富集成功率高达98%以上。为解决客户样本量少的问题,云序早已经推出超微量MeRIP测序技术,500ng总RNA即可完成测序。特殊样本如血清,血浆,外泌体和石蜡等也可进行RNA修饰测序。m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。云序技术优势,可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰。

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